Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm12875-201ENSMUST00000118745 344 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm14983-201ENSMUST00000121551 323 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TtrP07309 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Rhox4c-201ENSMUST00000115183 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm15520-201ENSMUST00000132097 1203 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TtrP07309 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms