Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Crlf3Q9Z2L7 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Crlf3Q9Z2L7 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Crlf3Q9Z2L7 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Crlf3Q9Z2L7 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Crlf3Q9Z2L7 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Crlf3Q9Z2L7 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Crlf3Q9Z2L7 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms