Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Irx1P81068 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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Irx1P81068 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms