Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ephx1-202ENSMUST00000111068 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Rbx1-201ENSMUST00000023036 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Kng1-203ENSMUST00000089902 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Afap1l2-202ENSMUST00000118800 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm28989-201ENSMUST00000187867 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm37258-201ENSMUST00000191734 1627 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Eif4enif1-201ENSMUST00000020734 3565 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Nefm-201ENSMUST00000022638 3334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ifih1-202ENSMUST00000112459 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Tfpi-206ENSMUST00000111718 2027 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC123058.1-201ENSMUST00000223748 437 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC154849.1-201ENSMUST00000224873 960 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1402-201ENSMUST00000060912 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gapdhs-201ENSMUST00000074758 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm15066-201ENSMUST00000120163 2608 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gsdma2-202ENSMUST00000093938 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm32335-201ENSMUST00000216896 2948 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Oog4-201ENSMUST00000061277 1981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 D830032E09Rik-203ENSMUST00000189845 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Cecr2-201ENSMUST00000100993 4849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Nat10-201ENSMUST00000028608 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm10364-201ENSMUST00000076633 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 G3bp2-201ENSMUST00000113127 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Selenop-201ENSMUST00000082424 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Nfam1-201ENSMUST00000023076 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Epn2-202ENSMUST00000108711 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d14-221ENSMUST00000171385 3884 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gprc5c-202ENSMUST00000053361 3667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Lrtm2-202ENSMUST00000112756 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Sprr2a2-201ENSMUST00000071805 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ube2v1-201ENSMUST00000060645 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Pramef6-201ENSMUST00000081645 1487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Card11-201ENSMUST00000085786 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm23835-201ENSMUST00000104439 132 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm15585-201ENSMUST00000149696 670 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm43711-201ENSMUST00000195994 373 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms