Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms