Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnga1P29974 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnga1P29974 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms