Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms