Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Shq1Q7TMX5 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Shq1Q7TMX5 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms