Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms