Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms