Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm20485-201ENSMUST00000174452 394 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC133183.2-201ENSMUST00000221543 280 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mfap5-201ENSMUST00000032210 946 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr298-201ENSMUST00000077800 999 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mrgprb4-201ENSMUST00000094388 1219 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 1600012P17Rik-201ENSMUST00000062159 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12142-201ENSMUST00000117114 485 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms