Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Casp8-202ENSMUST00000165549 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms