Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms