Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms