Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RxraP28700 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
RxraP28700 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RxraP28700 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RxraP28700 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RxraP28700 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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