Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
P20040 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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P20040 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P20040 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P20040 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P20040 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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