Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Sf3b2-201ENSMUST00000025774 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm5262-201ENSMUST00000180655 996 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC164879.1-201ENSMUST00000227904 1021 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC155941.2-201ENSMUST00000218795 1861 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Zfp536-206ENSMUST00000176205 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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