Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms