Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nphp4P59240 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms