Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tcaf1-203ENSMUST00000121083 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Serpina3f-201ENSMUST00000101080 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm10556-201ENSMUST00000180904 3906 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nrg4-213ENSMUST00000164721 1927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm43219-201ENSMUST00000197972 1937 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm44317-201ENSMUST00000204314 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Sec23a-204ENSMUST00000165134 2529 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4930425K24Rik-201ENSMUST00000222054 2143 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Kng1-203ENSMUST00000089902 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 4136 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Lrrc66-201ENSMUST00000087177 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Atp5k-202ENSMUST00000118632 272 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12930-201ENSMUST00000146679 676 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12496-201ENSMUST00000154377 668 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm24838-201ENSMUST00000158684 130 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm6410-201ENSMUST00000181337 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm45698-201ENSMUST00000208537 1135 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 5830408C22Rik-204ENSMUST00000211653 351 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC120386.1-201ENSMUST00000213434 736 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC139381.1-201ENSMUST00000224215 478 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Atp5k-201ENSMUST00000049628 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm4149-201ENSMUST00000099371 276 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm44873-201ENSMUST00000208490 3428 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1810053B23Rik-204ENSMUST00000185971 1309 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15283-201ENSMUST00000125308 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Trim21-201ENSMUST00000033264 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm37821-201ENSMUST00000195476 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Zfp260-201ENSMUST00000050735 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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