Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Aph1b-202ENSMUST00000113730 682 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 AC167202.2-201ENSMUST00000220155 296 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 4921515L22Rik-201ENSMUST00000218993 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20795J3QP49 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms