Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Cyp17a1-201ENSMUST00000026012 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shq1Q7TMX5 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms