Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms