Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SrprbP47758 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms