Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12394-201ENSMUST00000107981 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms