Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms