Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms