Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clic1Q9Z1Q5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clic1Q9Z1Q5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms