Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms