Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Padi4Q9Z183 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi4Q9Z183 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms