Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn1Q9Z0I7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms