Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp46a1Q9WVK8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms