Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms