Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SnurfQ9WU12 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms