Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms