Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfwd2Q9R1A8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfwd2Q9R1A8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms