Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc26a4Q9R155 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc26a4Q9R155 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms