Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Nek3Q9R0A5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek3Q9R0A5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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