Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms