Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms