Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms