Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnnt3Q9QZ47 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt3Q9QZ47 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms