Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vnn3Q9QZ25 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vnn3Q9QZ25 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms