Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms