Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn4Q9QXZ9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms