Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms