Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms