Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf1Q9JM58 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf1Q9JM58 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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