Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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