Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk3aQ9JKX8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms